Система водоснабжения включает в себя две насосных станции: станцию №1, производительностью 450 м³/час, и станцию №2, производительностью 160 м³/час. Станция №1 была введена в эксплуатацию в 1968 году. Источником воды для насосной станции служат артезианские скважины, 4 из которых расположены в районе АТП и поселка Мирный, а так же 3 скважины, находящиеся на территории станции. Насосная станция обслуживает 7 и 8 микрорайоны Новоалтайска

Центральным объектом системы водоотведения города можно назвать канализационные очистные сооружения, которые рассчитаны на полную биологическую очистку стоков.

Сброс порядка 17 тыс м³/сутки.
Эффективность очистки сточных вод анализируется химико-бактериологической лабораторией по 25 показателям.